El Consejo Asesor es responsable de guiar al Consejo Directivo y al Equipo Operativo de Protortuga en la toma de decisiones técnicas y estratégicas de la iniciativa, para asegurar la consecución de sus objetivos de conservación, educación e investigación científica.
El Consejo Asesor acompaña a Protortuga desde su diseño y sus miembros son profesionales de larga trayectoria relacionada al mundo de la conservación marina. Ellos son Marvin del Cid, Laura Villalobos, Rita Sellares y Omar Shamir, quienes participan Ad-honorem en la iniciativa.